Onderzoekers uit India hebben referentiegenomen gegenereerd voor vier bedreigde soorten Aziatische neushoornvogels. rapporten bijdrager Nikhil Sreekandan voor Mongabay India.
De wetenschappers van de Nature Conservation Foundation (NCF) in Mysore en het CSIR-Centre for Cellular and Molecular Biology (CCMB) in Hyderabad hebben hoogwaardige genomen samengesteld voor bedreigde Aziatische neushoornvogelsoorten, waaronder de grote neushoornvogel.Buceros bicornis), roodhalsneushoornvogel (Aceros nipalensis), Malabarbonte neushoornvogel (Anthracoceros coronatus), en gekrulde neushoornvogel (Rhyticeros undulatus).
Voorafgaand hieraan studieVoor slechts twee van de 32 soorten Aziatische neushoornvogels was informatie over het hele genoom beschikbaar.
Het onderzoeksteam gebruikte twee soorten genetische sequencing om genetische kaarten voor elk van de soorten te maken; Samen hielpen kort- en langgelezen DNA-sequencing onderzoekers om fouten te minimaliseren.
“Een genoom is de volledige genetische structuur van een organisme, (en) een referentiegenoom is een basisgenoom voor een bepaalde soort”, zegt Pooja Pawar, corresponderend auteur van de studie en doctoraal onderzoeker bij NCF.
Pawar zei dat genomische hulpmiddelen wetenschappers in staat stellen de geschiedenis van soorten in de regio en in de loop van de tijd te onderzoeken. “Ik zou terug in de tijd kunnen gaan, naar het moment waarop de soort ontstond of afweek van zijn zustersoort, en mijn onderzoek niet beperken tot de West-Ghats of Noordoost-India.”
Het team gebruikte statistische modellen om veranderingen in neushoornvogelpopulaties in de loop van de tijd te traceren, en ontdekte dat klimatologische instabiliteit tijdens het Pleistoceen (2,5 miljoen tot 11.000 jaar geleden) de effectieve populatiegrootte van alle vier de soorten verkleinde. Onder hen had de wijd verspreide neushoornvogel een hogere effectieve populatiegrootte dan de andere drie.
Meghana Natesh, een geneticus op het gebied van natuurbehoud bij WWF India die niet betrokken was bij het onderzoek, zei dat genomica onderzoekers ook in staat stelt de genetische variatie in populaties te begrijpen. “Genetische variatie of diversiteit is cruciaal voor het aanpassingspotentieel en de veerkracht van populaties op lange termijn,” zei ze. Daarom bieden de bevindingen een fundamenteel hulpmiddel voor het evalueren van de veerkracht van de bevolking en het informeren van natuurbehoudsbeheer.
“Door hun genomen te vergelijken, kunnen we verschillen in hun kenmerken toeschrijven aan de structurele en functionele variaties binnen hun genomen,” zei Pawar.
Lees het volledige verhaal van Nikhil Sreekandan hier.
Bannerafbeelding: De roodhalsneushoornvogel wordt aangetroffen in dichte bossen in het noordoosten van India, met enkele van de hoogste aantallen in de staat Arunachal Pradesh. Afbeelding door Shiv’s fotografia via Wikimedia Commons (CC BY 4.0).
